ハクビシンとか猫とかが屋根裏に入り込んでる可能性もある。2階に君達家族がいるときは警戒して極力物音を立てないように過ごしているのかも。糞尿で家が駄目になる危険もあるので、そんなにしょっちゅう音がして心配なら調べてみては。